3.4. C/C++编程接口¶
在3.2和3.3节中,分别讨论了开发者如何利用Python来定义机器学习的整个工作流,以及如何定义复杂的深度神经网络。然而,在很多时候,开发者也需要添加自定义的算子来帮助实现新的模型,优化器,数据处理函数等。这些自定义算子需要通过C和C++实现,从而获得最优性能。但是为了帮助这些算子被开发者使用,他们也需要暴露为Python函数,从而方便开发者整合入已有的Python为核心编写的工作流和模型。在这一小节中,我们讨论这一过程是如何实现的。
3.4.1. 在Python中调用C/C++函数的原理¶
由于Python的解释器是由C实现的,因此在Python中可以实现对于C和C++函数的调用。现代机器学习框架(包括TensorFlow,PyTorch和MindSpore)主要依赖Pybind11来将底层的大量C和C++函数自动生成对应的Python函数,这一过程一般被称为Python绑定( Binding)。在Pybind11出现以前,将C和C++函数进行Python绑定的手段主要包括:
Python的C-API。这种方式要求在一个C++程序中包含Python.h,并使用Python的C-API对Python语言进行操作。使用这套API需要对Python的底层实现有一定了解,比如如何管理引用计数等,具有较高的使用门槛。
简单包装界面产生器(Simplified Wrapper and Interface Generator,SWIG)。SWIG可以将C和C++代码暴露给Python。SWIG是TensorFlow早期使用的方式。这种方式需要用户编写一个复杂的SWIG接口声明文件,并使用SWIG自动生成使用Python C-API的C代码。自动生成的代码可读性很低,因此具有很大代码维护开销。
Python的ctypes模块,提供了C语言中的类型,以及直接调用动态链接库的能力。缺点是依赖于C的原生的类型,对自定义类型支持不好。
Cython是结合了Python和C语言的一种语言,可以简单的认为就是给Python加上了静态类型后的语法,使用者可以维持大部分的Python语法。Cython编写的函数会被自动转译为C和C++代码,因此在Cython中可以插入对于C/C++函数的调用。
Boost::Python是一个C++库。它可以将C++函数暴露为Python函数。其原理和Python C-API类似,但是使用方法更简单。然而,由于引入了Boost库,因此有沉重的第三方依赖。
相对于上述的提供Python绑定的手段,Pybind11提供了类似于Boost::Python的简洁性和易用性,但是其通过专注支持C++ 11,并且去除Boost依赖,因此成为了轻量级的Python库,从而特别适合在一个复杂的C++项目(例如本书讨论的机器学习系统)中暴露大量的Python函数。
3.4.2. 添加C++编写的自定义算子¶
算子是构建神经网络的基础,在前面也称为低级API;通过算子的封装可以实现各类神经网络层,当开发神经网络层遇到内置算子无法满足时,可以通过自定义算子来实现。以MindSpore为例,实现一个GPU算子需要如下步骤:
Primitive注册:算子原语是构建网络模型的基础单元,用户可以直接或者间接调用算子原语搭建一个神经网络模型。
GPU Kernel实现:GPU Kernel用于调用GPU实现加速计算。
GPU Kernel注册:算子注册用于将GPU Kernel及必要信息注册给框架,由框架完成对GPU Kernel的调用。
1.注册算子原语 算子原语通常包括算子名、算子输入、算子属性(初始化时需要填的参数,如卷积的stride、padding)、输入数据合法性校验、输出数据类型推导和维度推导。假设需要编写加法算子,主要内容如下:
算子名:TensorAdd
算子属性:构造函数__init__中初始化属性,因加法没有属性,因此__init__不需要额外输入。
算子输入输出及合法性校验:infer_shape方法中约束两个输入维度必须相同,输出的维度和输入维度相同。infer_dtype方法中约束两个输入数据必须是float32类型,输出的数据类型和输入数据类型相同。
算子输出
MindSpore中实现注册TensorAdd代码如下:
# mindspore/ops/operations/math_ops.py
class TensorAdd(PrimitiveWithInfer):
"""
Adds two input tensors element-wise.
"""
@prim_attr_register
def __init__(self):
self.init_prim_io_names(inputs=['x1', 'x2'], outputs=['y'])
def infer_shape(self, x1_shape, x2_shape):
validator.check_integer('input dims', len(x1_shape), len(x2_shape), Rel.EQ, self.name)
for i in range(len(x1_shape)):
validator.check_integer('input_shape', x1_shape[i], x2_shape[i], Rel.EQ, self.name)
return x1_shape
def infer_dtype(self, x1_dtype, x2_type):
validator.check_tensor_type_same({'x1_dtype': x1_dtype}, [mstype.float32], self.name)
validator.check_tensor_type_same({'x2_dtype': x2_dtype}, [mstype.float32], self.name)
return x1_dtype
在mindspore/ops/operations/math_ops.py文件内注册加法算子原语后,需要在mindspore/ops/operations/__init__中导出,方便python导入模块时候调用。
# mindspore/ops/operations/__init__.py
from .math_ops import (Abs, ACos, ..., TensorAdd)
__all__ = [
'ReverseSequence',
'CropAndResize',
...,
'TensorAdd'
]
2.GPU算子开发继承GPUKernel,实现加法使用类模板定义TensorAddGpuKernel,需要实现以下方法:
Init(): 用于完成GPU Kernel的初始化,通常包括记录算子输入/输出维度,完成Launch前的准备工作;因此在此记录Tensor元素个数。
GetInputSizeList():向框架反馈输入Tensor需要占用的显存字节数;返回了输入Tensor需要占用的字节数,TensorAdd有两个Input,每个Input占用字节数为element_num\(\ast\)sizeof(T)。
GetOutputSizeList():向框架反馈输出Tensor需要占用的显存字节数;返回了输出Tensor需要占用的字节数,TensorAdd有一个output,占用element_num\(\ast\)sizeof(T)字节。
GetWorkspaceSizeList():向框架反馈Workspace字节数,Workspace是用于计算过程中存放临时数据的空间;由于TensorAdd不需要Workspace,因此GetWorkspaceSizeList()返回空的std::vector<size_t>。
Launch(): 通常调用CUDA kernel(CUDA kernel是基于Nvidia GPU的并行计算架构开发的核函数),或者cuDNN接口等方式,完成算子在GPU上加速;Launch()接收input、output在显存的地址,接着调用TensorAdd完成加速。
// mindspore/ccsrc/backend/kernel_compiler/gpu/math/tensor_add_v2_gpu_kernel.h
template <typename T>
class TensorAddGpuKernel : public GpuKernel {
public:
TensorAddGpuKernel() : element_num_(1) {}
~TensorAddGpuKernel() override = default;
bool Init(const CNodePtr &kernel_node) override {
auto shape = AnfAlgo::GetPrevNodeOutputInferShape(kernel_node, 0);
for (size_t i = 0; i < shape.size(); i++) {
element_num_ *= shape[i];
}
InitSizeLists();
return true;
}
const std::vector<size_t> &GetInputSizeList() const override { return input_size_list_; }
const std::vector<size_t> &GetOutputSizeList() const override { return output_size_list_; }
const std::vector<size_t> &GetWorkspaceSizeList() const override { return workspace_size_list_; }
bool Launch(const std::vector<AddressPtr> &inputs, const std::vector<AddressPtr> &,
const std::vector<AddressPtr> &outputs, void *stream_ptr) override {
T *x1 = GetDeviceAddress<T>(inputs, 0);
T *x2 = GetDeviceAddress<T>(inputs, 1);
T *y = GetDeviceAddress<T>(outputs, 0);
TensorAdd(element_num_, x1, x2, y, reinterpret_cast<cudaStream_t>(stream_ptr));
return true;
}
protected:
void InitSizeLists() override {
input_size_list_.push_back(element_num_ * sizeof(T));
input_size_list_.push_back(element_num_ * sizeof(T));
output_size_list_.push_back(element_num_ * sizeof(T));
}
private:
size_t element_num_;
std::vector<size_t> input_size_list_;
std::vector<size_t> output_size_list_;
std::vector<size_t> workspace_size_list_;
};
TensorAdd中调用了CUDA kernelTensorAddKernel来实现element_num个元素的并行相加:
// mindspore/ccsrc/backend/kernel_compiler/gpu/math/tensor_add_v2_gpu_kernel.h
template <typename T>
__global__ void TensorAddKernel(const size_t element_num, const T* x1, const T* x2, T* y) {
for (size_t i = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x; i < element_num; i += blockDim.x * gridDim.x) {
y[i] = x1[i] + x2[i];
}
}
template <typename T>
void TensorAdd(const size_t &element_num, const T* x1, const T* x2, T* y, cudaStream_t stream){
size_t thread_per_block = 256;
size_t block_per_grid = (element_num + thread_per_block - 1 ) / thread_per_block;
TensorAddKernel<<<block_per_grid, thread_per_block, 0, stream>>>(element_num, x1, x2, y);
return;
}
template void TensorAdd(const size_t &element_num, const float* x1, const float* x2, float* y, cudaStream_t stream);
3.GPU算子注册算子信息包含1.Primive;2.Input dtype, output dtype;3.GPU Kernel class; 4.CUDA内置数据类型。框架会根据Primive和Input dtype, output dtype,调用以CUDA内置数据类型实例化GPU Kernel class模板类。如下代码中分别注册了支持float和int的TensorAdd算子。
// mindspore/ccsrc/backend/kernel_compiler/gpu/math/tensor_add_v2_gpu_kernel.cc
MS_REG_GPU_KERNEL_ONE(TensorAddV2, KernelAttr()
.AddInputAttr(kNumberTypeFloat32)
.AddInputAttr(kNumberTypeFloat32)
.AddOutputAttr(kNumberTypeFloat32),
TensorAddV2GpuKernel, float)
MS_REG_GPU_KERNEL_ONE(TensorAddV2, KernelAttr()
.AddInputAttr(kNumberTypeInt32)
.AddInputAttr(kNumberTypeInt32)
.AddOutputAttr(kNumberTypeInt32),
TensorAddV2GpuKernel, int)
完成上述三步工作后,需要把MindSpore重新编译,在源码的根目录执行bash build.sh -e gpu,最后使用算子进行验证。